MF Researcher Database

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Advance

Yoshida Hiromi

  • Faculty of Medicine
  • School of Medicine
  • Associate Professor
Last Updated :2025/04/24

Researcher Information

Degree

  • Doctor (Engineering)（Tokyo University of Agriculture and Technology）
  • Master (Engineering)（Tokyo University of Agriculture and Technology）

J-Global ID

Research Interests

  • oxidoreductase   Carbohydrate-active enzymes   rare sugar   構造生物学   タンパク質工学   structural biology   protein engineering   

Research Areas

  • Life sciences / Structural biochemistry

Academic & Professional Experience

  • 2009 - Today  Tokyo University of Agriculture and Technology
  • 2007 - Today  香川大学総合生命科学研究センター, 准教授
  • 2004 - 2007  Kagawa UniversityInformation Technology Center
  • 2002 - 2004  Laboratory of Biophysical Chemistry, University of Groningen (The Netherlands), Postdoctoral fellow
  • 2002 - 2002  海洋バイオテクノロジー研究所, 博士研究員
  • 2001 - 2002  海洋バイオテクノロジー研究所, NEDO養成技術者
  • 2001 - 2002  Marine Biotechnology Institute, New Energy and Industrial Technology Development Organization (NEDO) fellow
  • 2001 - 2002  Marine Biotechnology Institute, Postdoctoral fellow
  • 1999 - 2001  Tokyo University of Agriculture and TechnologyFaculty of Engineering助手
  • 1999 - 2001  Department of Biotechnology, Faculty of Technology, Tokyo University of Agriculture and Technology, Research Associate

Education

  •        - 1999  Tokyo University of Agriculture and Technology  Graduate School, Division of Engineering  Department of Biotechnology
  •        - 1999  Tokyo University of Agriculture and Technology  工学研究科  物質生物工学専攻
  •        - 1996  Tokyo University of Agriculture and Technology  Graduate School, Division of Engineering  Department of Biotechnology
  •        - 1994  Tokyo University of Agriculture and Technology  Faculty of Engineering  Department of Biotechnology
  •        - 1994  Tokyo University of Agriculture and Technology  Faculty of Engineering  物質生物工学科

Association Memberships

  • The Crystallographic Society of Japan   The Japanese Biochemical Society   Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry   Protein Science Society of Japan   The Society for Biotechnology   

Published Papers

Books etc

  • SH Domains: Structure, Mechanisms and Applications
    Springer 2015 9783319200972
  • Recent Res.Devel. Protein Eng.
    Research Signpost (ISBN: 81-7736-147-3) 2002

Conference Activities & Talks

  • Understanding the recognition of 1-deoxy rare sugar by Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase based on X-ray structure analyses  [Not invited]
    Hiromi Yoshida; Akihide Yoshihara; Ken Izumori; Shigehiro Kamitori
    日本農芸化学会2024年度大会  2024/03  東京農業大学、東京  日本農芸化学会
  • 希少糖生産酵素の基質認識および触媒反応機構  [Invited]
    吉田裕美
    23-1 バイオ・高分子研究会  2023/09  高松、香川  高分子学会 バイオ・高分子研究会
  • X-ray structure of recombinant ribitol dehydrogenase from Klebsiella oxytoca  [Invited]
    Hiromi Yoshida; Akihide Yoshihara; Naho Yamamoto; Ken Izumori; Shigehiro Kamitori
    Rare Sugar Congress 2023  2023/04  Kagawa, Japan  International Society of Rare Sugars
  • Expression and X-ray structure analysis of recombinant ribitol dehydrogenase from Klebsiella oxytoca  [Not invited]
    Hiromi Yoshida; Akihide Yoshihara; Naho Yamamoto; Ken Izumori; Shigehiro Kamitori
    2023年度日本農芸化学会大会  2023/03
  • X-ray structure of L-Lactate oxidase from Enterococcus hirae in compl ex with D-lactate form provides insight into the product inhibition mode  [Not invited]
    Hiromi Yoshida; Kentaro Hiraka; Koji Sode
    第95回日本生化学会大会  2022/11
  • X-ray structure analysis of recombinant L-ribulose 3-epimerase from Shinella zoogloeoides NN6 in complex with D-allulose
    Hiromi Yoshida; Akihide Yoshihara; Takuma Suzuki; Kenji Morimoto; Shigehiro Kamitori
    The 2022 Annual Meeting of the Japan Society for Bioscience, Biotechnology and Agrochemistry  2022/03
  • X-ray structure of Super oxide dismutase from Staphylococcus equorum and the role of Ser126
    Hiromi Yoshida; Debbie S. Retnoningrum; Muthia D. Razani; Rahmat Muliadi; Vincencius F. Meidianto; Anita Artarini; Wangsa T. Ismaya; Shigehiro Kamitori
    The 94th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society  2021/11
  • Structure comparison of two ketose 3-epimerases from Shinella zoogloeoides which are capable of D-allulose production  [Not invited]
    Hiromi Yoshida; Akihide Yoshihara; Takuma Suzuki; Kenji Morimoto; Shigehiro Kamitori
    The 45th FEBS Congress  2021/07
  • The X-ray structures of Methylomonas sp. L-ribulose 3-epimerase in co mplexes with substrates  [Not invited]
    Hiromi Yoshida
    The 21st Annual meeting of Protein Science Society of Japan  2021/06
  • Expression and X-ray structure analysis of recombinant L-rhamnose isomerase from Lactobacillus rhamnosus  [Not invited]
    Hiromi Yoshida
    2021年度日本農芸化学会大会  2021/03
  • X-ray structures of Pseudomonas cichorii D-tagatose 3-epimerase in complexes with rare sugars and deoxy rare sugars, providing insights into the mechanism for substrate recognition  [Invited]
    YOSHIDA Hiromi
    16th Conference of the Asian Crystallographic Association  2019/12
  • X-RAY STRUCTURE ANALYSIS OF PSEUDOMONAS CICHORII D-TAGATOSE 3-EPIMERASE AND ARTHROBACTER GLOBIFORMIS KETOSE 3-EPIMERASE  [Not invited]
    YOSHIDA Hiromi
    Rare Sugar Congress 2019  2019/12
  • X-ray structure analysis and preliminary characterization of Thermus thermophilus HB8 transketolase  [Not invited]
    YOSHIDA Hiromi
    The Society for Biotechnology, Japan/Annual Meeting 2019  2019/09
  • X-ray structure of a novel ketose 3-epimerase from Shinella zoogloeods which is capable of D-allulose production  [Not invited]
    YOSHIDA Hiromi
    The 44th FEBS Congress  2019/07
  • Expression and X-ray structure analysis of recombinant Methylomonas sp. D-allulose 3-epimerase  [Not invited]
    YOSHIDA Hiromi
    The 2019 Annual meeting of The Japan Society for Bioscience, Biotechnology and Agrochemistry  2019/03
  • X-ray structure of Arthrobacter globiformis M30 ketose 3-epimerase which is useful for D-allulose production  [Not invited]
    YOSHIDA Hiromi
    43rd FEBS Congress  2018/07
  • Crystal structure analysis of Burkholderia cepacia FAD-dependent glucose dehydrogenase  [Not invited]
    YOSHIDA Hiromi
    The 18th Annual meeting of Protein Science Society of Japan  2018/06
  • X-ray structure analysis of Oryza sativa hexokinase 6 which recognizes D-allose as substrate  [Not invited]
    YOSHIDA Hiromi
    The 2018 Annual meeting of The Japan Society for Bioscience, Biotechnology and Agrochemistry  2018/03
  • 希少糖生産酵素Arthrobacter属由来 D-アルロース 3-エピメラーゼの基質複合体構造解析  [Not invited]
    2017年度農芸化学会大会  2017
  • 希少糖D-alloseに作用するイネ由来ヘキソキナーゼ6のX線結晶構造解析  [Not invited]
    第17回日本蛋白質科学会年会  2017
  • X-ray structure analysis of fructosyl peptide oxidases to elucidate the residues responsible for the oxidative half-reaction  [Not invited]
    The 19th International Symposium on Flavins and Flavoproteins  2017
  • X-ray structure analysis of Arthrobacter sp. D-allulose 3-epimerase in complex with its substrate  [Not invited]
    2017年度農芸化学会大会  2017
  • Crystal structure of Oryza sative hexokinase 6 which shows enzymatic activity for D-allose  [Not invited]
    第17回日本蛋白質科学会年会  2017
  • X-ray structure analysis of fructosyl peptide oxidases to elucidate the residues responsible for the oxidative half-reaction  [Not invited]
    The 19th International Symposium on Flavins and Flavoproteins  2017
  • 希少糖生産酵素Arthrobacter 属由来 D-プシコース 3- エピメラーゼの結晶化およびX 線結晶解析  [Not invited]
    2016年度農芸化学会大会  2016
  • 微小重力環境で得られた希少糖生産酵素L-rhamnose isomerase 変異酵素の結晶を用いたデオキシ希少糖複合体の構造  [Not invited]
    第16回日本蛋白質科学会年会  2016
  • 希少糖生産関連酵素のＸ線結晶解析  [Not invited]
    日本農芸化学会中四国支部第45回講演会  2016
  • X-ray structure of recombinant fructosyl peptidyl oxidase from Phaeospaeria nodrum  [Not invited]
    EMBO meeting 2016  2016
  • Crystal Structures of the sugar epimerase for rare sugar production in complexes with deoxy sugars ~ Crystal structures of Pseudomonas cichorii D-tagatose 3-epimerase C66S in complexes with deoxy sugars ~  [Not invited]
    The 2nd International Symposium, Space Science of High Quality Protein Crystallization Technology  2016
  • Crystal structure of L-rhamnose isomerase from Arthrobacter globiformis  [Not invited]
    Rare Sugar Congress 2016  2016
  • Crystallization and crystal structure analysis of Arthrobacter D-allulose (D-psicose)  [Not invited]
    2016年度農芸化学会大会  2016
  • Crystal structure of L-rhamnose isomerase mutant form in complex with deoxy rare sugars using the crystal grown in microgravity  [Not invited]
    第16回日本蛋白質科学会年会  2016
  • 希少糖生産関連酵素のＸ線結晶解析  [Not invited]
    日本農芸化学会中四国支部第45回講演会  2016
  • X-ray structure of recombinant fructosyl peptidyl oxidase from Phaeospaeria nodrum  [Not invited]
    EMBO meeting 2016  2016
  • Crystal Structures of the sugar epimerase for rare sugar production in complexes with deoxy sugars ~ Crystal structures of Pseudomonas cichorii D-tagatose 3-epimerase C66S in complexes with deoxy sugars ~  [Not invited]
    The 2nd International Symposium, Space Science of High Quality Protein Crystallization Technology  2016
  • Crystal structure of L-rhamnose isomerase from Arthrobacter globiformis  [Not invited]
    Rare Sugar Congress 2016  2016
  • Cellulomonas parahominis由来L-リボースイソメラーゼの基質複合体構造解析および四量体形成の必要性の解明  [Not invited]
    日本農芸化学会  2015
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas cichorii由来D-タガトース3-エピメラーゼの変異酵素を用いた糖アルコールおよびデオキシ希少糖との複合体構造解析  [Not invited]
    日本農芸化学会2015年度大会、岡山大学、岡山  2015
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas cichorii D-タガトース 3-エピメラーゼとデオキシ希少糖との複合体のX線結晶解析  [Not invited]
    第56回日本生化学会中国四国支部例会、島根大学、島根  2015
  • ツメガエル由来の二種のプロト型ガレクチンついてのX線結晶構造解析  [Not invited]
    第１４回四国免疫フォーラム  2015
  • 宇宙空間で得られた希少糖生産酵素D-tagatose 3-epimerase 変異酵素の結晶とデオキシ希少糖との複合体構造  [Not invited]
    第15回日本蛋白質科学会年会  2015
  • ツメガエル皮膚ガレクチンの構造・機能解析とgalectin-1との比較  [Not invited]
    第15回日本蛋白質科学会年会  2015
  • X-ray structure of recombinant non-glycosylated FAD glucose dehydrogenase derived from Aspergillus flavus  [Not invited]
    40TH FEBS CONGRESS  2015
  • The First Three-Dimensional Structure of Fungus-Derived Glucose Dehydrogenase ~knowing enzyme for glucose monitoring~  [Not invited]
    Diabetes Technology Meeting2015  2015
  • ウェルシュ菌溶菌酵素オートライシン触媒ドメインのX線結晶解析  [Not invited]
    第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会大会合同大会  2015
  • Cellulomonas parahominis由来L-リボースイソメラーゼの基質複合体構造解析および四量体形成の必要性の解明  [Not invited]
    日本農芸化学会  2015
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas cichorii由来D-タガトース3-エピメラーゼの変異酵素を用いた糖アルコールおよびデオキシ希少糖との複合体構造解析  [Not invited]
    日本農芸化学会2015年度大会、岡山大学、岡山  2015
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas cichorii D-タガトース 3-エピメラーゼとデオキシ希少糖との複合体のX線結晶解析  [Not invited]
    第56回日本生化学会中国四国支部例会、島根大学、島根  2015
  • ツメガエル由来の二種のプロト型ガレクチンついてのX線結晶構造解析  [Not invited]
    第１４回四国免疫フォーラム  2015
  • Crystal structure of D-tagatose 3-epimerase mutant form in complex with deoxy rare sugars using the crystal grown in space  [Not invited]
    第15回日本蛋白質科学会年会  2015
  • Structural and functional analyses of Xenopus skin galectin and comparison with galectin-1  [Not invited]
    第15回日本蛋白質科学会年会  2015
  • X-ray structure of recombinant non-glycosylated FAD glucose dehydrogenase derived from Aspergillus flavus  [Not invited]
    40TH FEBS CONGRESS  2015
  • The First Three-Dimensional Structure of Fungus-Derived Glucose Dehydrogenase ~knowing enzyme for glucose monitoring~  [Not invited]
    Diabetes Technology Meeting2015  2015
  • X-ray structure of autolysin Clostridium perfringens catalytic domain  [Not invited]
    第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会大会合同大会  2015
  • 希少糖生産酵素Acinetobacter sp.由来 L-リボースイソメラーゼのX線結晶構造解析  [Not invited]
    2014年度農芸化学会大会  2014
  • アフリカツメガエルの皮膚および遍在型ガレクチンの立体構造解析  [Not invited]
    第14回日本蛋白質科学会年会  2014
  • 宇宙空間を利用した希少糖生産酵素の結晶化  [Not invited]
    第14回日本蛋白質科学会年会  2014
  • Crystal structure of L-ribose isomerase from Cellulomonas parahominis MB426  [Not invited]
    International Union of Crystallography 2014 (IUCr2014)  2014
  • X-ray structure analysis of Acinetobacter sp. L-ribose isomerase for metabolizing non-natural sugar L-ribose  [Not invited]
    FEBS-EMBO 2014  2014
  • アフリカツメガエル皮膚由来ガレクチンの立体構造と機能の解析  [Not invited]
    第87回日本生化学会大会  2014
  • Crystal structure of L-ribose isomerase from Acinetobacter sp. which is useful for rare sugar production  [Not invited]
    2014年度農芸化学会大会  2014
  • Structural analyses of skin-derived and ubiquitous galectins from Xenopus laevis  [Not invited]
    第14回日本蛋白質科学会年会  2014
  • Crystallization study of enzyme for rare sugar production in space  [Not invited]
    第14回日本蛋白質科学会年会  2014
  • Crystal structure of L-ribose isomerase from Cellulomonas parahominis MB426  [Not invited]
    International Union of Crystallography 2014 (IUCr2014)  2014
  • X-ray structure analysis of Acinetobacter sp. L-ribose isomerase for metabolizing non-natural sugar L-ribose  [Not invited]
    FEBS-EMBO 2014  2014
  • Analyses of the structure and function of Xenopus laevis skin galectin  [Not invited]
    第87回日本生化学会大会  2014
  • ファージ由来ウェルシュ菌特異的溶菌酵素Psmの触媒ドメインの結晶構造  [Not invited]
    2013年度農芸化学会大会  2013
  • 安定型ヒト由来ガレクチン9変異体のＸ線結晶構造解析  [Not invited]
    第13回日本蛋白質科学会年会  2013
  • X-ray structure of a stable protease-resistant glectin-9 with short linker  [Not invited]
    38th FEBS Congress  2013
  • ヒトガレクチン9変異体のX線構造と糖鎖親和性の解析  [Not invited]
    第86回日本生化学会大会  2013
  • Pseudomonas cichorii ST-24株由来のD-tagatose 3-epimeraseおよびその単糖異性化中間体の電子状態計算  [Not invited]
    錯体化学会第63回討論会  2013
  • X-ray structure of catalytic domain of a phage endolysin specific to Clostridium perfringens SM101  [Not invited]
    2013年度農芸化学会大会  2013
  • X-ray structure analysis of a stable protease-resistant human galectin-9 mutant  [Not invited]
    第13回日本蛋白質科学会年会  2013
  • X-ray structure of a stable protease-resistant glectin-9 with short linker  [Not invited]
    38th FEBS Congress  2013
  • X-ray structures and oligosaccharide-binding affinity analyses of galectin-9 mutant forms  [Not invited]
    第86回日本生化学会大会  2013
  • Pseudomonas cichorii ST-24株由来のD-tagatose 3-epimeraseおよびその単糖異性化中間体の電子状態計算  [Not invited]
    錯体化学会第63回討論会  2013
  • 糖環開環機構の解明を目指したPseudomonas stutzeri 由来 L-ラムノースイソメラーゼ変異酵素の構造解析  [Not invited]
    2012年度農芸化学会大会  2012
  • ウェルシュ菌特異的溶菌酵素Psmの酵素活性中心の解析  [Not invited]
    第85回日本細菌学会総会  2012
  • サルモネラ菌の接着に関与するβ型外膜蛋白質PagCおよびRckの巻戻しと結晶化  [Not invited]
    第12回日本蛋白質科学会年会  2012
  • X-ray structure analysis of a phage endolysin showing specificity for Clostridium perfringens  [Not invited]
    第12回日本蛋白質科学会年会  2012
  • The study of ring-opening mechanism in L-rhamnose isomerase mutant from Pseudomonas stutzeri based on X-ray structure  [Not invited]
    2012年度農芸化学会大会  2012
  • Studies of the catalytic center of Psm, an endolysin specific to Clostridium perfringens  [Not invited]
    第85回日本細菌学会総会  2012
  • サルモネラ菌の接着に関与するβ型外膜蛋白質PagCおよびRckの巻戻しと結晶化  [Not invited]
    第12回日本蛋白質科学会年会  2012
  • X-ray structure analysis of a phage endolysin showing specificity for Clostridium perfringens  [Not invited]
    第12回日本蛋白質科学会年会  2012
  • X-ray structure of L-ribose isomerase in complex with L-ribose and a deduced catalytic mechanism  [Not invited]
    22nd IUBMB 37th FEBS Congress  2012
  • X線構造解析によるPseudomonas cichorii D-タガトース3-エピメラーゼにおける1-deoxy 3-keto-D-galactitolの認識機構に関する研究  [Not invited]
    第85回日本生化学会大会、福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡  2012
  • X-ray structure of L-ribose isomerase in complex with L-ribose and a deduced catalytic mechanism  [Not invited]
    22nd IUBMB 37th FEBS Congress  2012
  • X線構造解析によるPseudomonas cichorii D-タガトース3-エピメラーゼにおける1-deoxy 3-keto-D-galactitolの認識機構に関する研究  [Not invited]
    第85回日本生化学会大会、福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡  2012
  • ボツリヌス菌C型神経毒素複合体におけるヘマグルチニンの糖鎖認識機構の構造研究  [Not invited]
    第11回日本蛋白質科学会年会  2011
  • プロテアーゼ耐性型ヒト由来ガレクチン8/シアリルラクトース/ラクトース複合体のＸ線結晶解析によるドメイン間の基質親和性の検討  [Not invited]
    第11回日本蛋白質科学会年会  2011
  • Crystal structure of a rare sugar producible enzyme L-ribose isomerase from Acinetobacter sp.  [Not invited]
    36th FEBS Congress  2011
  • 希少糖単結晶および単分子における安定構造と電子状態  [Not invited]
    第24回DV-Xα研究会  2011
  • ボツリヌス菌C型神経毒素複合体におけるヘマグルチニンHA3・糖鎖複合体のX線結晶解析  [Not invited]
    第84回日本生化学会大会  2011
  • ヒトガレクチン8N末端糖鎖認識ドメインと3'-sialyl-Nlacetyllactosamine複合体のX線結晶解析  [Not invited]
    第84回日本生化学会大会  2011
  • ウェルシュ菌特異的溶菌酵素Psmの構造と機能解析  [Not invited]
    第64回日本細菌学会中国・四国支部総会  2011
  • Structure analysis of mutant L-rhamnose isomerase from Pseudomonas stutzeri to elucidate the ring opening mechanism  [Not invited]
    Rare Sugar Congress 2011  2011
  • Crystal Structures and Electronic Structures of Rare Sugar Molecules and Supermolecules  [Not invited]
    The 5th Symposium of International Society of Rare Sugar (Rare Sugar Congress 2011)  2011
  • X-Ray Structures of the Enzymes used for Rare Sugar Production and their Catalytic Reaction Mechanisms  [Not invited]
    The 5th Symposium of International Society of Rare Sugar (Rare Sugar Congress 2011)  2011
  • X-Ray Structure of 1-Deoxy-1-Fluoro-L-Tagatose  [Not invited]
    The 5th Symposium of International Society of Rare Sugar (Rare Sugar Congress 2011)  2011
  • ボツリヌス菌C型神経毒素複合体におけるヘマグルチニンの糖鎖認識機構の構造研究  [Not invited]
    第11回日本蛋白質科学会年会  2011
  • プロテアーゼ耐性型ヒト由来ガレクチン8/シアリルラクトース/ラクトース複合体のＸ線結晶解析によるドメイン間の基質親和性の検討  [Not invited]
    第11回日本蛋白質科学会年会  2011
  • Crystal structure of a rare sugar producible enzyme L-ribose isomerase from Acinetobacter sp.  [Not invited]
    36th FEBS Congress  2011
  • 希少糖単結晶および単分子における安定構造と電子状態  [Not invited]
    第24回DV-Xα研究会  2011
  • ボツリヌス菌C型神経毒素複合体におけるヘマグルチニンHA3・糖鎖複合体のX線結晶解析  [Not invited]
    第84回日本生化学会大会  2011
  • ヒトガレクチン8N末端糖鎖認識ドメインと3'-sialyl-Nlacetyllactosamine複合体のX線結晶解析  [Not invited]
    第84回日本生化学会大会  2011
  • ウェルシュ菌特異的溶菌酵素Psmの構造と機能解析  [Not invited]
    第64回日本細菌学会中国・四国支部総会  2011
  • Structure analysis of mutant L-rhamnose isomerase from Pseudomonas stutzeri to elucidate the ring opening mechanism  [Not invited]
    Rare Sugar Congress 2011  2011
  • Crystal Structures and Electronic Structures of Rare Sugar Molecules and Supermolecules  [Not invited]
    The 5th Symposium of International Society of Rare Sugar (Rare Sugar Congress 2011)  2011
  • X-Ray Structures of the Enzymes used for Rare Sugar Production and their Catalytic Reaction Mechanisms  [Not invited]
    The 5th Symposium of International Society of Rare Sugar (Rare Sugar Congress 2011)  2011
  • X-Ray Structure of 1-Deoxy-1-Fluoro-L-Tagatose  [Not invited]
    The 5th Symposium of International Society of Rare Sugar (Rare Sugar Congress 2011)  2011
  • 希少糖のX線構造解析と電子状態計算  [Not invited]
    日本化学会第90春季年会  2010
  • C末端領域の改変によるPseudomonas stutzeri由来L-ラムノースイソメラーゼの酵素活性への影響  [Not invited]
    2010年度農芸化学会大会  2010
  • Crystal structure of the C-terminal carbohydrate recognition domain of human galectin-9  [Not invited]
    35th FEBS Congress  2010
  • ヒト由来ガレクチン9のC末端糖鎖認識ドメイン・シアリルラクトース複合体およびプロテアーゼ耐性型ヒト由来ガレクチン8のＸ線結晶解析  [Not invited]
    第10回日本蛋白質科学会年会  2010
  • X-ray Structure of Galectin-9 C-terminal Domain in Complex with  [Not invited]
    The 25th International Carbohydrate Symposium (ICS2010)  2010
  • X-ray structures of rare sugar production related enzymes and the catalytic mechanisms  [Not invited]
    The 25th International Carbohydrate Symposium (ICS2010)  2010
  • X-Ray Structure Analyses and Electronic Structure of Rare Sugars  [Not invited]
    The 6th International Conference on DV-Xα Method, Daejeon, Korea  2010
  • Acinetobacter sp. strain DL-28由来L-ribose isomeraseの結晶化及び予備的X線回折実験  [Not invited]
    第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会  2010
  • Crystal Structure of D-Tagatose 3-Epimerase Cys66Ser from Pseudomonas Cichorii  [Not invited]
    2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2010)  2010
  • 希少糖のX線構造解析と電子状態計算  [Not invited]
    日本化学会第90春季年会  2010
  • An effect on enzymatic activity of Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase by truncating of C-terminal region  [Not invited]
    2010年度農芸化学会大会  2010
  • Crystal structure of the C-terminal carbohydrate recognition domain of human galectin-9  [Not invited]
    35th FEBS Congress  2010
  • X-ray structures of protease-resistant form of human galectin-8 and the C-terminal domain of human galectin-9 bound with Sialyllactose  [Not invited]
    第10回日本蛋白質科学会年会  2010
  • X-ray Structure of Galectin-9 C-terminal Domain in Complex with  [Not invited]
    The 25th International Carbohydrate Symposium (ICS2010)  2010
  • X-ray structures of rare sugar production related enzymes and the catalytic mechanisms  [Not invited]
    The 25th International Carbohydrate Symposium (ICS2010)  2010
  • X-Ray Structure Analyses and Electronic Structure of Rare Sugars  [Not invited]
    The 6th International Conference on DV-Xα Method, Daejeon, Korea  2010
  • Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of L-ribose isomerase from Acinetobacter sp. strain DL-28  [Not invited]
    第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会  2010
  • Crystal Structure of D-Tagatose 3-Epimerase Cys66Ser from Pseudomonas Cichorii  [Not invited]
    2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2010)  2010
  • Crystal Structure of Rare Sugar Producing Enzyme, Pseudomonas stutzeri L-rhamnose Isomerase and its Catalytic Mechanism  [Not invited]
    38thNSC2009 (38th National Seminar on Crystalography)  2009
  • Bacillus pallidus由来D-アラビノースイソメラーゼのX線結晶構造解析と希少糖生産  [Not invited]
    2009年度農芸化学会大会  2009
  • 変異酵素の結晶解析に基づくPseudomonas stutzeri由来L-ラムノースイソメラーゼにおけるC末端領域の役割  [Not invited]
    2009年度農芸化学会大会  2009
  • Bacillus pallidus由来D-アラビノースイソメラーゼのX線結晶解析と希少糖生産  [Not invited]
    2009年度農芸化学会大会  2009
  • MHPC dioxygenaseのX線結晶構造解析  [Not invited]
    第50回日本生化学会 中国・四国支部例会  2009
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomeraseの変異酵素を利用した糖環の開環機構  [Not invited]
    第50回日本生化学会 中国・四国支部例会  2009
  • The role of flexible C-terminal region of Pseudomonas stutzeri L-Rhamnose Isomerase  [Not invited]
    34th FEBS Congress  2009
  • An effect on enzymatic activity of rare sugar producible enzyme Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase by truncating the C-terminal region  [Not invited]
    Enzyme Engineering XX  2009
  • プロテアーゼ耐性変異型ヒトガレクチン8のX線結晶解析  [Not invited]
    第82回日本生化学会大会  2009
  • Bacillus pallidus 由来のD-アラビノースイソメラーゼとL-フシトール複合体のX線結晶構造解析  [Not invited]
    第82回日本生化学会大会  2009
  • ピリジン環分解ジオキシゲナーゼ（MHPCO）の機能におけるTyr270の働き  [Not invited]
    第82回日本生化学会大会  2009
  • 天然型単糖からの希少糖生産と生産酵素について  [Not invited]
    第13回生体触媒化学シンポジウム in Kagawa  2009
  • Crystal Structure of Rare Sugar Producing Enzyme, Pseudomonas stutzeri L--rhamnose Isomerase and its Catalytic Mechanism  [Not invited]
    38thNSC2009 (38th National Seminar on Crystalography)  2009
  • The role of C-terminal region of Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase based on crystal structures of Ser329 mutants  [Not invited]
    2009年度農芸化学会大会  2009
  • X-ray structure of Bacillus pallidus D-arabinose isomerase and production of rare sugars  [Not invited]
    2009年度農芸化学会大会  2009
  • MHPC dioxygenaseのX線結晶構造解析  [Not invited]
    第50回日本生化学会 中国・四国支部例会  2009
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomeraseの変異酵素を利用した糖環の開環機構  [Not invited]
    第50回日本生化学会 中国・四国支部例会  2009
  • The role of flexible C-terminal region of Pseudomonas stutzeri L-Rhamnose Isomerase  [Not invited]
    34th FEBS Congress  2009
  • An effect on enzymatic activity of rare sugar producible enzyme Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase by truncating the C-terminal region  [Not invited]
    Enzyme Engineering XX  2009
  • X-ray structure of a protease-resistant mutant form of human galectin-8  [Not invited]
    第82回日本生化学会大会  2009
  • X-ray structure of D-arabinose isomerase and L-fcitol complex from Bacillus pallidus  [Not invited]
    第82回日本生化学会大会  2009
  • Role of Tyr270 in function of pyridine ring-opening dioxygenase (MHPCO)  [Not invited]
    第82回日本生化学会大会  2009
  • Rare sugar production using enzymatic reaction and the catalytic reaction mechanisms of rare sugar producing enzymes  [Not invited]
    第13回生体触媒化学シンポジウム in Kagawa  2009
  • X線結晶解析に基づくPseudomonas stutzeri 由来L-ラムノースイソメラーゼにおけるSer329の基質認識への影響  [Not invited]
    2008年度農芸化学会大会  2008
  • 希少糖D-Tagatose及びD-ArabinoseのX線構造解析  [Not invited]
    日本化学会第88春季年会  2008
  • Pseudomonas stutzeri 由来のL-ラムノースイソメラーゼ・Mg2+複合体のX線結晶構造解析と酵素活性に及ぼす金属イオンの影響  [Not invited]
    2008年度農芸化学会大会  2008
  • Functional and structural bases of a cysteine-less mutant as a long-lasting substitute for galectin-1  [Not invited]
    第49回日本生化学会 中国・四国支部例会  2008
  • Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｌｌｉｄｕｓ由来のＤ‐アラビノースイソメラーゼの精製，結晶化および予備的Ｘ線結晶構造解析  [Not invited]
    日本生化学会  2008
  • The role of Cys66 of D-tagatose 3-epimerase from Pseudomonas cichorii on the basis of the crystal structure and its site-directed mutagenesis study  [Not invited]
    XXIV International Carbohydrate Symposium  2008
  • Structural basis of a cysteine-less mutant as a long-lasting substitute for galectin-1  [Not invited]
    XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2008
  • X-ray structure of TTHA1281 from Thermus thermophilus HB8  [Not invited]
    XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2008
  • Crystallization and preliminary X-ray analysis of D-arabinose isomerase from Bacillus pallidus  [Not invited]
    XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2008
  • X-ray structure of D-arabinose isomerase from Bacillus pallidus.  [Not invited]
    Rare Sugar Congress 2008 in Kagawa  2008
  • Crystal Structures of Rare Sugars  [Not invited]
    The 4th Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2008 in Kagawa)  2008
  • X-ray Structural Analyses and Molecular Orbital Calculations of Rare Sugar Single Crystals  [Not invited]
    The 4th Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2008 in Kagawa)  2008
  • Cys残基をSer残基に置換したガレクチン−１変異体（安定化ガレクチン−１）の機能と構造  [Not invited]
    第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会  2008
  • Pseudomonas stutzeri L-ラムノースイソメラーゼの触媒反応機構に関与する アミノ酸残基改変型酵素のX線結晶構造解析  [Not invited]
    第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)  2008
  • X線結晶解析に基づくPseudomonas stutzeri 由来L-ラムノースイソメラーゼにおけるSer329の基質認識への影響  [Not invited]
    2008年度農芸化学会大会  2008
  • 希少糖D-Tagatose及びD-ArabinoseのX線構造解析  [Not invited]
    日本化学会第88春季年会  2008
  • Pseudomonas stutzeri 由来のL-ラムノースイソメラーゼ・Mg2+複合体のX線結晶構造解析と酵素活性に及ぼす金属イオンの影響  [Not invited]
    2008年度農芸化学会大会  2008
  • Functional and structural bases of a cysteine-less mutant as a long-lasting substitute for galectin-1  [Not invited]
    第49回日本生化学会 中国・四国支部例会  2008
  • Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｌｌｉｄｕｓ由来のＤ‐アラビノースイソメラーゼの精製，結晶化および予備的Ｘ線結晶構造解析  [Not invited]
    日本生化学会  2008
  • The role of Cys66 of D-tagatose 3-epimerase from Pseudomonas cichorii on the basis of the crystal structure and its site-directed mutagenesis study  [Not invited]
    XXIV International Carbohydrate Symposium  2008
  • Structural basis of a cysteine-less mutant as a long-lasting substitute for galectin-1  [Not invited]
    XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2008
  • X-ray structure of TTHA1281 from Thermus thermophilus HB8  [Not invited]
    XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2008
  • Crystallization and preliminary X-ray analysis of D-arabinose isomerase from Bacillus pallidus  [Not invited]
    XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2008
  • X-ray structure of D-arabinose isomerase from Bacillus pallidus.  [Not invited]
    Rare Sugar Congress 2008 in Kagawa  2008
  • Crystal Structures of Rare Sugars  [Not invited]
    The 4th Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2008 in Kagawa)  2008
  • X-ray Structural Analyses and Molecular Orbital Calculations of Rare Sugar Single Crystals  [Not invited]
    The 4th Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2008 in Kagawa)  2008
  • Functional and structural bases of a cysteine-less mutant as a long-lasting substitute for galectin-1  [Not invited]
    第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会  2008
  • Pseudomonas stutzeri L-ラムノースイソメラーゼの触媒反応機構に関与する アミノ酸残基改変型酵素のX線結晶構造解析  [Not invited]
    第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)  2008
  • Pseudomonas cichorii 由来D-タガトース3-エピメラーゼのX 線結晶解析  [Not invited]
    2007年度農芸化学会大会  2007
  • 土壌菌L-ラムノースイソメラーゼの触媒反応機構における金属イオンの役割  [Not invited]
    第48回日本生化学会中国・四国支部例会  2007
  • Binding modes of microglia-specific EF-hand protein Iba1 with targets deduced from X-ray structures  [Not invited]
    32nd FEBS Congress  2007
  • The role of metal ion on active site in Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase  [Not invited]
    32nd FEBS Congress  2007
  • Crystal structures of molybdenum cofactor biosynthesis proteins from Sulfolobus tokodaii  [Not invited]
    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007
  • Substrate-recognition mechanism of Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase based on X-ray structures and site-directed mutagenesis  [Not invited]
    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007
  • X-ray structure of hypotetical 56-kDa selenium-binding protein from Sulfolobus tokodaii  [Not invited]
    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007
  • 土壌菌Ｄ-タガトースエピメラーゼの構造と触媒反応機構  [Not invited]
    2007年度酵素・補酵素研究会  2007
  • Pseudomonas stutzeri 由来L-ラムノースイソメラーゼ変異酵素S329Fの構造解析と基質結合様式  [Not invited]
    第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会  2007
  • Bacillus stearothermophilus 由来のD-アラビノースイソメラーゼの結晶化  [Not invited]
    第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会  2007
  • Pseudomonas cichorii 由来D-タガトース3-エピメラーゼのX 線結晶解析  [Not invited]
    2007年度農芸化学会大会  2007
  • 土壌菌L-ラムノースイソメラーゼの触媒反応機構における金属イオンの役割  [Not invited]
    第48回日本生化学会中国・四国支部例会  2007
  • Binding modes of microglia-specific EF-hand protein Iba1 with targets deduced from X-ray structures  [Not invited]
    32nd FEBS Congress  2007
  • The role of metal ion on active site in Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase  [Not invited]
    32nd FEBS Congress  2007
  • Crystal structures of molybdenum cofactor biosynthesis proteins from Sulfolobus tokodaii  [Not invited]
    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007
  • Substrate-recognition mechanism of Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase based on X-ray structures and site-directed mutagenesis  [Not invited]
    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007
  • X-ray structure of hypotetical 56-kDa selenium-binding protein from Sulfolobus tokodaii  [Not invited]
    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007
  • 土壌菌Ｄ-タガトースエピメラーゼの構造と触媒反応機構  [Not invited]
    2007年度酵素・補酵素研究会  2007
  • Pseudomonas stutzeri 由来L-ラムノースイソメラーゼ変異酵素S329Fの構造解析と基質結合様式  [Not invited]
    第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会  2007
  • Bacillus stearothermophilus 由来のD-アラビノースイソメラーゼの結晶化  [Not invited]
    第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会  2007
  • Pseudomonas stutzeri 由来L-ラムノースイソメラーゼのX 線結晶解析  [Not invited]
    日本農芸化学会中四国支部第１５回講演会  2006
  • X-ray structure of microglia/macrophage-specific protein Iba1 and its binding study to actin and L-fimbrin  [Not invited]
    20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress  2006
  • Crystal Structure of L-rhamnose Isomerase from Pseudomonas stutzeri  [Not invited]
    XXIIIrd International Carbohydrate Symposium  2006
  • Roles of Two Sugar Binding Sites in Starch Binding Domain of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase 1  [Not invited]
    XXIIIrd International Carbohydrate Symposium  2006
  • Crystallization and Preliminary X-ray diffraction studies of D-Tagatose 3- Epimerase from Pseudomonas cichorii  [Not invited]
    The 3rd Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2006 in Kagawa)  2006
  • X-ray Structures of L-Rhamnose Isomerase from Pseudomonas stutzeri in Metal-binding Form and Metal-free Form  [Not invited]
    The 3rd Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2006 in Kagawa)  2006
  • The Structures of L-Rhamnose Isomerase from Pseudomonas stutzeri in Complexes with L-Rhamnose and D-Allose  [Not invited]
    The 3rd Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2006 in Kagawa)  2006
  • Pseudomonas stutzeri 由来L-ラムノースイソメラーゼのX 線結晶解析  [Not invited]
    日本農芸化学会中四国支部第１５回講演会  2006
  • X-ray structure of microglia/macrophage-specific protein Iba1 and its binding study to actin and L-fimbrin  [Not invited]
    20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress  2006
  • Crystal Structure of L-rhamnose Isomerase from Pseudomonas stutzeri  [Not invited]
    XXIIIrd International Carbohydrate Symposium  2006
  • Roles of Two Sugar Binding Sites in Starch Binding Domain of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase 1  [Not invited]
    XXIIIrd International Carbohydrate Symposium  2006
  • Crystallization and Preliminary X-ray diffraction studies of D-Tagatose 3- Epimerase from Pseudomonas cichorii  [Not invited]
    The 3rd Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2006 in Kagawa)  2006
  • X-ray Structures of L-Rhamnose Isomerase from Pseudomonas stutzeri in Metal-binding Form and Metal-free Form  [Not invited]
    The 3rd Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2006 in Kagawa)  2006
  • The Structures of L-Rhamnose Isomerase from Pseudomonas stutzeri in Complexes with L-Rhamnose and D-Allose  [Not invited]
    The 3rd Symposium of International Society of Rare Sugars (Rare Sugar Congress 2006 in Kagawa)  2006
  • 好熱性放線菌Thermoactinomyces vulgaris R-47由来シクロデキストリン結合タンパク質のX線結晶解析  [Not invited]
    日本生化学会－中国・四国支部例会－  2005
  • Crystal structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase 1 (TVA1) complex with pullulan-analog substrates  [Not invited]
    日本生化学会年会  2005
  • Refined structure of Thermophilic cytochrome P450 from Sulfolobus tokodaii at 2.0 Å  [Not invited]
    日本生化学会年会  2005
  • Crystal structure of macrophage/microglia-specific calcium-binding protein Iba1  [Not invited]
    日本生化学会年会  2005
  • 好熱性放線菌シクロデキストリン膜輸送に関わるCBPのX線結晶解析  [Not invited]
    日本結晶学会年会  2005
  • 好熱性放線菌Thermoactinomyces vulgaris R-47由来シクロデキストリン結合タンパク質のX線結晶解析  [Not invited]
    日本生化学会－中国・四国支部例会－  2005
  • Crystal structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase 1 (TVA1) complex with pullulan-analog substrates  [Not invited]
    日本生化学会年会  2005
  • Refined structure of Thermophilic cytochrome P450 from Sulfolobus tokodaii at 2.0 Å  [Not invited]
    日本生化学会年会  2005
  • Crystal structure of macrophage/microglia-specific calcium-binding protein Iba1  [Not invited]
    日本生化学会年会  2005
  • 好熱性放線菌シクロデキストリン膜輸送に関わるCBPのX線結晶解析  [Not invited]
    日本結晶学会年会  2005
  • Crystallization study of acyl coenzyme A isopenicillin Nacyltransferase from Penicillium chrysogenum  [Not invited]
    日本結晶学会年会  2004
  • Crystallization study of acyl coenzyme A isopenicillin Nacyltransferase from Penicillium chrysogenum  [Not invited]
    日本結晶学会年会  2004

Works

  • 希少糖生産酵素の触媒反応機構解明に向けた宇宙環境を利用した高品質タンパク質結晶生成と精密立体構造の解析
    2016 -2017
  • 希少糖生産酵素の触媒反応機構解明に向けた宇宙環境を利用した高品質タンパク質結晶生成（第2回実験）と精密立体構造の解析
    2014 -2015
  • 希少糖生産酵素の触媒反応機構解明に向けた宇宙環境を利用した高品質タンパク質結晶生成（第1回実験）と精密立体構造の解析
    2013 -2014
  • 宇宙環境を利用した高品質タンパク質結晶生成（第6回実験）と精密立体構造の解析
    2012 -2013

MISC

  • Klebsiella pneumoniae40b由来ポリオールデヒドロゲナーゼを用いたケトース・糖アルコール間の効率的な転換
    山本菜帆; 吉田裕美; 望月進; 何森健; 吉原明秀  日本農芸化学会西日本支部大会およびシンポジウム講演要旨集  2023 (CD-ROM)-  2023
  • Thermus thermophilus HB8由来トランスケトラーゼを用いた七炭糖生産と効率的な生産条件の検討
    綿貫花菜; 高松陽太; 望月進; 花木祐輔; 吉田裕美; 神鳥成弘; 何森健; 吉原明秀  日本農芸化学会西日本支部大会およびシンポジウム講演要旨集  2023 (CD-ROM)-  2023
  • Reaction of a rare sugar D-allose with bacterial allokinases
    塚本郁子; 吉田裕美; 神鳥成弘  日本糖質学会年会要旨集  41st-  2022
  • Enzymatic activities of human hexokinases to a rare sugar, D-allose
    塚本郁子; 神鳥和代; 徳田雅明; 吉田裕美; 神鳥成弘  日本薬学会年会要旨集(Web)  142nd-  2022
  • Human hexokinase 3 has a high enzymatic activity to a rare sugar, D-allose
    塚本郁子; 井上圭介; 前川聖; 神鳥和代; 徳田雅明; 吉田裕美; 神鳥成弘  日本糖質学会年会要旨集  40th-  2021
  • Methylomonas属由来L-ribulose3-epimeraseの基質複合体の構造解析
    吉田裕美; 吉原明秀; 何森健; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  21st-  2021
  • Expression and X-ray structure analysis of recombinant L-rhamnose isomerase from Lactobacillus rhamnosus
    吉田裕美; 吉原明秀; 倉原琳; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2021-  2021
  • Thermus thermophilus HB8由来組換えトランスケトラーゼを用いた七炭糖生産
    高松陽太; 吉田裕美; 神鳥成弘; 何森健; 吉原明秀  日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web)  59th-  2021
  • D-allose作用機構におけるイネG6PDHの機能解析
    萩原奏; 大谷夏生; 安喜絢花; 松平一志; 加野彰人; 福元健志; 大谷耕平; 吉田裕美; 加藤志郎; 五味剣二; 市村和也; 吉原明秀; 何森健; 秋光和也; 望月進  日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web)  58th-  2021
  • X-ray structure of Pseudomonas stutzeriL-rhamnose isomerase mutant in complex with deoxy rare sugars using the crystal grown in International Space Station
    吉田裕美; 吉原明秀; 田仲広明; 伊中浩治; 山田貢; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2020-  2020
  • 希少糖の植物への作用(52):D‐Alloseシグナル伝達に重要なリン酸化産物A6Pの生産について
    松平一志; 加野彰人; 望月進; 大谷耕平; 福元健志; 吉原明秀; 何森健; 小原敏明; 石田豊; 神鳥成弘; 吉田裕美; 市村和也; 五味剣二; 秋光和也  日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2019-  153  2019/03
  • Methylomonas sp.由来D‐アルロース3‐エピメラーゼの発現と構造解析
    吉田裕美; 吉原明秀; 加藤志郎; 望月進; 秋光和也; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2019-  ROMBUNNO.1E1a06 (WEB ONLY)  2019/03
  • 単糖合成を目指した高度好熱菌由来トランスケトラーゼのX線結晶構造解析および諸性質の検討
    吉田裕美; 吉原明秀; 塚本郁子; 秋光和也; 何森健; 増井良治; 神鳥成弘  日本生物工学会大会講演要旨集  71st-  2019
  • ガレクチン10・単糖複合体のX線結晶構造解析
    野中康宏; 伊藤愛子; 吉田裕美; 中北愼一; 中村隆範; 西望; 神鳥成弘  日本生化学会大会(Web)  92nd-  2019
  • 植物‐微生物間相互作用の現場における希少糖の作用とその応用展開の可能性
    望月進; 松平一志; 大谷夏生; 加野彰人; 福元健志; 大谷耕平; 小原敏明; KONG Lingbing; 吉田裕美; 吉原明秀; 石田豊; 神鳥成弘; 五味剣二; 市村和也; 何森健; 秋光和也  日本植物病理学会植物感染生理談話会論文集  (53)  9‐18  2018/08
  • 希少糖の植物への作用(49):OsHXK5においてD‐allose結合に関係するアミノ酸の特定
    松平一志; 加野彰人; 望月進; 大谷耕平; 福元健志; 吉原明秀; 何森健; 小原敏明; 石田豊; 神鳥成弘; 吉田裕美; 市村和也; 五味剣二; 秋光和也  日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2018-  93  2018/03
  • 希少糖D-alloseを基質とするイネ由来ヘキソキナーゼ6のX線結晶解析
    吉田裕美; 松平一志; 望月進; 何森健; 秋光和也; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2018-  2018
  • 希少糖の植物への作用(46):D-Alloseを基質とするOsHXK5の酵素学的諸性質
    松平一志; 加野彰人; 馬越史奈; 井上恵; 遠矢将大; 福元健志; 望月進; 吉原明秀; 何森健; 大谷耕平; 小原敏明; 石田豊; 神鳥成弘; 吉田裕美; 市村和也; 五味剣二; 秋光和也  日本植物病理学会報  84-  (1)  2018
  • ガレクチンの立体構造と糖鎖結合能の相関性についての解析
    野中康宏; 小川崇; 東海林博樹; 吉田裕美; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本生化学会大会(Web)  91st-  2018
  • 希少糖の植物への作用(44):希少糖をリン酸化するOsHXK6の糖結合領域の解析
    松平一志; 加野彰人; 馬越史奈; 望月進; 大谷耕平; 福元健志; 吉原明秀; 何森健; 小原敏明; 重松由夫; 石田豊; 神鳥成弘; 吉田裕美; 市村和也; 五味剣二; 秋光和也  日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2017-  2017
  • Escherichia coli由来フルクトサミン6-キナーゼの構造解析
    鈴木啓太; 吉田裕美; 津川若子; 浅野竜太郎; 早出広司  日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)  97th-  2017
  • 希少糖D-alloseに作用するイネ由来ヘキソキナーゼ6のX線結晶構造解析
    吉田裕美; 松平一志; 望月進; 何森健; 秋光和也; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  17th-  2017
  • 希少糖生産酵素Arthrobacter属由来D-アルロース3-エピメラーゼの基質複合体構造解析
    吉田裕美; 吉原明秀; GULLAPALLI Pushpa Kiran; 大谷耕平; 秋光和也; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2017-  2017
  • 真菌由来FAD依存型グルコース酸化還元酵素の人工電子受容体選択性の改良
    鈴木ななみ; 大栗田円香; 吉田裕美; 森一茂; 小嶋勝博; 早出広司  電気化学秋季大会講演要旨集(CD-ROM)  2017-  2017
  • ウェルシュ菌Sortase BのX線結晶解析
    神鳥成弘; 吉田裕美; 玉井栄治  KEK Progress Report (Web)  (2017-10)  2017
  • フルクトサミン6-キナーゼを用いた新規糖化アルブミン計測法の開発
    鈴木啓太; 吉田裕美; 津川若子; 浅野竜太郎; 早出広司  酵素工学研究会講演会講演要旨集  78th-  2017
  • ガレクチン-1の糖鎖特異性および多量体構造とアポトーシス誘導活性の相関について
    野中康宏; 小川崇; 吉田裕美; 東海林博樹; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本生化学会大会(Web)  90th-  2017
  • ウエルシュ菌細胞壁分解酵素Acpの構造と機能解析
    玉井栄治; 関谷洋志; 巻幡奈保美; 吉田裕美; 神鳥成弘; 牧純  日本細菌学雑誌(Web)  72-  (1)  2017
  • 希少糖の植物への作用(42):イネにおいてD-alloseをリン酸化するOsHXK6の基質特異性に関する解析
    松平一志; 加野彰人; 馬越史奈; 井上恵; 福元健志; 望月進; 吉原明秀; 何森健; 小原敏明; 重松由夫; 石田豊; 神鳥成弘; 吉田裕美; 大谷耕平; 市村和也; 五味剣二; 秋光和也  日本植物病理学会報  83-  (1)  2017
  • 希少糖の植物への作用(40):イネの希少糖リン酸化酵素OsHXK6,OsFK1の機能解析
    松平一志; 加野彰人; 馬越史奈; 望月進; 大谷耕平; 福元健志; 吉原明秀; 何森健; 小原敏明; 重松由夫; 石田豊; 神鳥成弘; 吉田裕美; 市村和也; 五味剣二; 秋光和也  日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2016-  2016
  • 真菌由来FADグルコース脱水素酵素の結晶構造解析に基づくメディエータとの相互作用の解析
    大栗田円香; 吉田裕美; 森一茂; 小嶋勝博; 早出広司  電気化学会大会講演要旨集(CD-ROM)  83rd-  2016
  • 希少糖生産酵素Arthrobacter属由来D-プシコース3-エピメラーゼの結晶化およびX線結晶解析
    吉田裕美; 吉原明秀; 大谷耕平; 秋光和也; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2016-  2016
  • ウェルシュ菌Sortase BのX線結晶解析
    神鳥成弘; 吉田裕美; 玉井栄治; 関谷洋志; 牧純; 成谷宏文  日本生化学会大会(Web)  89th-  2016
  • 真菌由来FADグルコース脱水素酵素の基質認識残基への変異導入
    空田明日香; 森一茂; 小嶋勝博; 吉田裕美; 早出広司  電気化学会大会講演要旨集(CD-ROM)  83rd-  2016
  • 希少糖生産関連酵素のX線結晶解析
    吉田裕美  日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web)  45th-  2016
  • Phaeosphaeria nodorum由来フルクトシルペプチド酸化酵素のX線結晶構造解析
    島崎智久; 吉田裕美; 小嶋勝博; 津川若子; 早出広司  日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)  96th-  2016
  • ヒトガレクチン-1とツメガエルガレクチン-Vaの糖鎖選択性を決める構造的要因について
    野中康宏; 小川崇; 吉田裕美; 東海林博樹; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  16th-  2016
  • ヒトガレクチン-1とツメガエルガレクチン-Vaの比較による,ガレクチンの構造と機能についての解析
    野中康宏; 小川崇; 吉田裕美; 東海林博樹; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本生化学会大会(Web)  89th-  2016
  • X-ray structure of recombinant nonglycosylated FAD glucose dehydrogenase derived from Aspergillus flavus
    H. Yoshida; G. Sakai; K. Kojima; S. Kamitori; K. Sode  FEBS JOURNAL  282-  279  -279  2015/07
  • Y. Nonaka; H. Yoshida; S. Kamitori; T. Nakamura  2015/04
  • Cellulomonas parahominis由来L-リボースイソメラーゼの基質複合体構造解析および四量体形成の必要性の解明
    寺見優司; 上地敬子; 森本兼司; 吉田裕美; 神鳥成弘; 高田悟郎  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2015-  2015
  • 宇宙空間で得られた希少糖生産酵素D-tagatose 3-epimerase変異酵素の結晶とデオキシ希少糖との複合体構造
    吉田裕美; 吉原明秀; 田仲広明; 伊中浩治; 古林直樹; 山田貢; 太田和敬; 何森健; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  15th-  2015
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas cichorii由来D-タガトース3-エピメラーゼの変異酵素を用いた糖アルコールおよびデオキシ希少糖との複合体構造解析
    吉田裕美; 吉原明秀; 石井知彦; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2015-  2015
  • ウェルシュ菌溶菌酵素オートライシン触媒ドメインのX線結晶解析
    吉田裕美; 玉井栄治; 関谷洋志; 牧純; 神鳥成弘  日本生化学会大会(Web)  88th-  2015
  • ツメガエル皮膚ガレクチンの構造・機能解析とgalectin-1との比較
    野中康宏; 小川崇; 吉田裕美; 東海林博樹; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  15th-  2015
  • ツメガエル皮膚ガレクチンの立体構造とアロステリックな挙動についての解析
    野中康宏; 小川崇; 吉田裕美; 東海林博樹; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本生化学会大会(Web)  88th-  2015
  • 真菌由来FADグルコース脱水素酵素の結晶構造解析に基づく活性中心残基の解析
    早出広司; 早出広司; 吉田裕美; 空田明日香; 坂井元気; 森一茂; 小嶋勝博  電気化学秋季大会講演要旨集(CD-ROM)  2015-  2015
  • X-ray structure analysis of Acinetobacter sp L-ribose isomerase for metabolizing non-natural sugar L-ribose
    H. Yoshida; A. Yoshihara; M. Teraoka; Y. Terami; G. Takata; K. Izumori; S. Kamitori  FEBS JOURNAL  281-  614  -615  2014/09
  • 宇宙空間を利用した希少糖生産酵素の結晶化
    吉田裕美; 吉原明秀; 寺岡美沙; 林順司; 田仲広明; 伊中浩治; 太田和敬; 何森健; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  14th-  2014
  • 希少糖生産酵素Acinetobacter sp.由来L-リボースイソメラーゼのX線結晶構造解析
    吉田裕美; 吉原明秀; 寺岡美沙; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2014-  2014
  • アフリカツメガエルの皮膚および遍在型ガレクチンの立体構造解析
    野中康宏; 吉田裕美; 小川崇; 東海林博樹; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  14th-  2014
  • 希少糖生産酵素Geodermatophilus obscurus NBRC13315株由来L-リボースイソメラーゼの諸性質の検討およびX線結晶構造解析
    寺見優司; 上地敬子; 高田悟郎; 吉田裕美; 神鳥成弘  日本生物工学会大会講演要旨集  66th-  2014
  • アフリカツメガエル皮膚由来ガレクチンの立体構造と機能の解析
    野中康宏; 吉田裕美; 小川崇; 東海林博樹; 西望; 神鳥成弘; 中村隆範  日本生化学会大会(Web)  87th-  2014
  • X-ray structure of a stable protease-resistant glectin-9 with short linker
    H. Yoshida; N. Nishi; M. Teraoka; S. Yamashita; S. Kamitori  FEBS JOURNAL  280-  531  -531  2013/07
  • Pseudomonas cichorii ST-24株由来のD-tagatose 3-epimeraseおよびそれに関わる単糖異性化中間体の電子状態計算
    大賀俊輔; 石井知彦; 茅原静佳; 土屋公奈; 妹尾辰也; 神鳥成弘; 吉田裕美; 坂根弦太  錯体化学会討論会講演要旨集  63rd-  2013
  • ファージ由来ウェルシュ菌特異的溶菌酵素Psmの触媒ドメインの結晶構造解析
    吉田裕美; 玉井栄治; 関谷洋志; 牧純; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2013-  2013
  • ウェルシュ菌ファージ由来エンドライシン(Psm)のX線結晶解析
    神鳥成弘; 吉田裕美; 玉井栄治; 関谷洋志; 牧純  日本結晶学会年会講演要旨集  2013-  2013
  • 安定型ヒト由来ガレクチン9変異体のX線結晶構造解析
    吉田裕美; 西望; 寺岡美沙; 山下哲; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  13th-  2013
  • ヒトガレクチン9変異体のX線構造と糖鎖親和性の解析
    寺岡美沙; 吉田裕美; 西望; 中北愼一; 神鳥成弘  日本生化学会大会(Web)  86th-  2013
  • Thermus thermophilus HB8由来グルコシル/マンノシルグリセリン酸分解酵素とリガンドとの複合体の構造解析
    市川めぐみ; 宮崎剛亜; 吉田裕美; 神鳥成弘; 西河淳; 殿塚隆史  日本生化学会大会(Web)  86th-  2013
  • X-ray structure of L-ribose isomerase in complex with L-ribose and a deduced catalytic mechanism
    H. Yoshida; M. Teraoka; A. Yoshihara; K. Izumori; S. Kamitori  FEBS JOURNAL  279-  431  -431  2012/09
  • ウエルシュ菌特異的溶菌酵素Psmの酵素活性中心の解析
    玉井栄治; 関谷洋志; 吉田裕美; 成谷宏文; 神鳥成弘; 桑原知巳; 牧純  日本細菌学雑誌  67-  (1)  2012
  • 糖環開環機構の解明を目指したPseudomonas stutzeri由来L-ラムノースイソメラーゼ変異酵素の構造解析
    吉田裕美; 寺岡美沙; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2012-  2012
  • X線構造解析によるPseudomonas cichorii D-タガトース3-エピメラーゼにおける1-deoxy3-keto-D-galactitolの認識機構に関する研究
    吉田裕美; 茅原静香; 吉原明秀; 寺岡美沙; 石井知彦; 何森健; 神鳥成弘  日本生化学会大会(Web)  85th-  2012
  • サルモネラ菌の接着に関与するβ型外膜蛋白質PagCおよびRckの巻戻しと結晶化
    山下哲; 吉田裕美; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  12th-  2012
  • Crystal structure of a rare sugar producible enzyme L-ribose isomerase from Acinetobacter sp.
    H. Yoshida; M. Teraoka; A. Yoshihara; K. Izumori; S. Kamitori  FEBS JOURNAL  278-  133  -134  2011/06
  • プロテアーゼ耐性型ヒト由来ガレクチン8/シアリルラクトース/ラクトース複合体のX線結晶解析によるドメイン間の基質親和性の検討
    吉田裕美; 西望; 寺岡美沙; 山下哲; 中北愼一; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  11th-  2011
  • ボツリヌス菌C型神経毒素複合体におけるヘマグルチニンの糖鎖認識機構の構造研究
    山下哲; 吉田裕美; 殿塚隆史; 小熊惠二; 西川淳; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  11th-  2011
  • 新規EFハンドタンパク質Iba1の2量体形成をともなうコンフォメーション変化に関する研究
    吉田裕美; 寺岡美沙; 大澤圭子; 高坂新一; 神鳥成弘  日本化学会講演予稿集  91st-  (3)  2011
  • ボツリヌス菌C型神経毒素複合体におけるヘマグルチニンHA3・糖鎖複合体のX線結晶解析
    山下哲; 吉田裕美; 殿塚隆史; 小熊惠二; 西河淳; 神鳥成弘  生化学  2011
  • ヒトガレクチン8N末端側糖鎖認識ドメインと3’-sialyl-N-acetyllactosamine複合体のX線結晶解析
    寺岡美沙; 吉田裕美; 山下哲; 西望; 神鳥成弘  生化学  2011
  • X-Ray Structure Analyses and Electronic Structures of Rare Sugars
    田原康宏; 石井知彦; 山地正嗣; 渡部優史; 竹下圭; 神鳥成弘; 吉田裕美; 何森健  DV-Xα研究協会会報  23-  (1-2)  213  -216  2011
  • Stable Structure and Electronic Structure of Rare Sugar Single Crystal and Single Molecule
    S. Kayahara; A. Yamauchi; S. Ohga; Y. Tahara; T. Ishii; K. Fukada; K. Izumori; H. Yoshida; S. Kamitori; G. Sakane  Bull. Soc. Discrete Variational Xα, 24(1-2), 120-123 (2011).  24-  (1-2)  120  -123  2011
  • X-Ray Structure Analyses and Electronic Structure of Rare Sugars
    Y. Tahara; T. Ishii; M. Yamaji; Y. Yatanabe; K. Takeshima; S. Kamitori; H. Yoshida; K. Izumori  Bull. Soc. Discrete Variational Xα, 23(1-2), 213-216 (2010).  23-  (1-2)  213  -216  2011
  • Stable Structure and Electronic Structure of Rare Sugar Single Crystal and Single Molecule
    S. Kayahara; A. Yamauchi; S. Ohga; Y. Tahara; T. Ishii; K. Fukada; K. Izumori; H. Yoshida; S. Kamitori; G. Sakane  Bull. Soc. Discrete Variational Xα, 24(1-2), 120-123 (2011).  24-  (1-2)  120  -123  2011
  • Crystal structure of the C-terminal carbohydrate recognition domain of human galectin-9
    H. Yoshida; M. Teraoka; N. Nishi; T. Nakamura; M. Hirashima; S. Kamitori  FEBS JOURNAL  277-  240  -240  2010/06
  • 希少糖のX線構造解析と電子論的考察
    田原康宏; 山地正嗣; 渡部優史; 竹下圭; 石井知彦; 神鳥成弘; 吉田裕美; 何森健  日本化学会講演予稿集  90th-  (3)  2010
  • C末端領域の改変によるPseudomonas stutzeri由来L-ラムノースイソメラーゼの酵素活性への影響
    吉田裕美; 武田耕青; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集  2010-  2010
  • Acinetobacter sp.strain DL-28由来L-ribose isomeraseの結晶化及び予備的X線回折実験
    寺岡美沙; 吉田裕美; 武田耕青; 吉原明秀; 何森健; 神鳥成弘  生化学  2010
  • 動的光散乱による新規EFハンドタンパク質Iba1のコンフォメーション変化に関する研究
    吉田裕美; 大澤圭子; 高坂新一; 神鳥成弘  日本化学会講演予稿集  90th-  (3)  2010
  • ヒト由来ガレクチン9のC末端糖鎖認識ドメイン・シアリルラクトース複合体およびプロテアーゼ耐性型ヒト由来ガレクチン8のX線結晶解析
    吉田裕美; 西望; 寺岡美沙; 中北愼一; 中村隆範; 平島光臣; 神鳥成弘  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  10th-  2010
  • X線構造に基づくガレクチン9のシアル化糖鎖認識機構の解明
    吉田裕美; 寺岡美沙; 西望; 中北愼一; 中村隆範; 平島光臣; 神鳥成弘  日本結晶学会年会講演要旨集  2010-  2010
  • ピリジン環分解ジオキシゲナーゼ(MHPCO)の機能におけるTyr270の働き
    小林淳; 八木年晴; 吉田裕美; CHU Nhat Huy; 神鳥成弘  生化学  ROMBUNNO.3T5A-2  2009/09
  • MHPC dioxygenaseのX線結晶構造解析
    小林淳; 吉田裕美; 神鳥成弘; 吉金優; 八木年晴  生化学  81-  (7)  640  2009/07
  • The role of flexible C-terminal region of Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase
    H. Yoshida; K. Takeda; K. Izumori; S. Kamitori  FEBS JOURNAL  276-  173  -173  2009/07
  • Bacillus pallidus由来D-アラビノースイソメラーゼのX線結晶構造解析と希少糖生産
    武田耕青; 吉原明秀; 吉田裕美; 森本兼司; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集  2009-  2009
  • 変異酵素の結晶解析に基づくPseudomonas stutzeri由来L-ラムノースイソメラーゼにおけるC末端領域の役割
    吉田裕美; 武田耕青; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集  2009-  2009
  • 希少糖生産酵素Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomeraseの変異酵素を利用した糖環の開環機構
    吉田裕美; 渡部優史; 武田耕青; 石井知彦; 何森健; 神鳥成弘  生化学  81-  (7)  2009
  • 天然型単糖からの希少糖生産と生産酵素について
    武田耕青; 吉田裕美; 吉原明秀; 森本兼司; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  生体触媒化学シンポジウム講演要旨集  13th-  2009
  • X線構造による希少糖生産酵素の単糖異性化反応機構の解析
    吉田裕美; 神鳥成弘  生化学  81-  (9)  2009
  • Bacillus pallidus由来のD-アラビノースイソメラーゼとL-フシトール複合体のX線結晶構造解析
    武田耕青; 吉田裕美; 森本兼司; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  生化学  2009
  • Thermoactinomyces vulgaris由来シクロ/マルトデキストリン結合タンパク質のオープン型とクローズ型の立体構造の比較
    殿塚隆史; 松本直樹; 山田貢; 倉方悠馬; 吉田裕美; 神鳥成弘; 西河淳  Journal of Applied Glycoscience  56-  (Suppl.)  2009
  • X線構造による希少糖生産酵素の単糖異性化反応機構
    吉田裕美; 神鳥成弘  生化学 (ミニレビュー)  81-  (9)  811  -815  2009
  • Pseudomonas stutzeri由来のL-ラムノースイソメラーゼ・Mg2複合体のX線結晶構造解析と酵素活性に及ぼす金属イオンの影響
    武田耕青; 吉田裕美; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集  2008-  2008
  • Bacillus pallidus由来のD-アラビノースイソメラーゼの精製,結晶化および予備的X線結晶構造解析
    武田耕青; 吉田裕美; 高田悟郎; 森本兼司; 何森健; 神鳥成弘  生化学  80-  (7)  2008
  • X線結晶解析に基づくPseudomonas stutzeri由来L-ラムノースイソメラーゼにおけるSer329の基質認識への影響
    吉田裕美; 武田耕青; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集  2008-  2008
  • 希少糖D-Tagatose及びD-ArabinoseのX線構造解析
    渡部優史; 武田耕晴; 勝本裕輔; 石井知彦; 神鳥成弘; 吉田裕美; 何森健  日本化学会講演予稿集  88th-  (2)  2008
  • Cys残基をSer残基に置換したガレクチン-1変異体(安定化ガレクチン-1)の機能と構造
    西望; 安部暁美; 岩城隼; 吉田裕美; 伊藤愛子; 東海林博樹; 神鳥成弘; 平林淳; 中村隆範  生化学  2008
  • Pseudomonas stutzeri L-ラムノースイソメラーゼの触媒反応機構に関与するアミノ酸残基改変型酵素のX線結晶構造解析
    吉田裕美; 渡部優史; 武田耕青; 石井知彦; 何森健; 神鳥成弘  生化学  2008
  • Binding modes of microglia-specific EF-hand protein Iba1 with targets deduced from X-ray structures
    S. Kamitori; M. Yamada; H. Yoshida; Y. Imai; K. Ohsawa; S. Kohsaka  FEBS JOURNAL  274-  261  -261  2007/07
  • The role of metal ion on active site in Pseudomonas stutzeri L-rhamnose isomerase
    H. Yoshida; M. Yamaji; M. Yamada; G. Takada; K. Izumori; T. Ishii; S. Kamitori  FEBS JOURNAL  274-  271  -271  2007/07
  • Pseudomonas stutzeri L-ラムノースイソメラーゼ変異酵素S329Fの構造解析と基質結合様式
    吉田裕美; 武田耕青; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  生化学  2007
  • Pseudomonas cichorii由来D-tagatose3-epimeraseのX線結晶解析
    吉田裕美; 山田貢; 西田岳頼; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  日本農芸化学会大会講演要旨集  2007-  2007
  • Bacillus stearothermophilus由来のD-アラビノースイソメラーゼの結晶化
    武田耕青; 吉田裕美; 森本兼司; 高田悟郎; 何森健; 神鳥成弘  生化学  2007
  • 好熱性放線菌由来シクロデキストリン代謝系の構造生物学
    殿塚隆史; 吉田裕美; 神鳥成弘; 西河淳; 坂野好幸  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集  7th-  2007
  • シクロデキストリン結合タンパク質と環状および直鎖オリゴ糖との複合体の結晶構造解析
    松本直樹; 殿塚隆史; 吉田裕美; 神鳥成弘; 西河淳; 坂野好幸  日本農芸化学会大会講演要旨集  2007-  2007
  • シクロ/マルトデキストリン結合タンパク質と各種シクロデキストリン等との複合体の結晶構造解析
    松本直樹; 山田貢; 吉田裕美; 神鳥成弘; 坂野好幸; 西河淳; 殿塚隆史  Journal of Applied Glycoscience  54-  (Suppl.)  2007
  • 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来TT1324のX線結晶解析
    安部暁美; 吉田裕美; 神鳥成弘; 上利佳弘; 金川真由美; 倉光成紀  高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト 第5回連携研究会 理研シンポジウム 平成18年  2006
  • 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来TT1592のX線結晶解析
    山田貢; 吉田裕美; 神鳥成弘; 神鳥成弘; 中川紀子; 中川紀子; 上利佳弘; 金川真由美; 倉光成紀; 倉光成紀  高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト 第5回連携研究会 理研シンポジウム 平成18年  2006
  • X-ray Structures of L-Rhamnose Isomerase from Pseudomonas stutzeri in Metal-binding Form and Metal-free Form
    S. Kamitori; H. Yoshida; M. Yamada; Y. Ohyama; G. Takata; K. Izumori; M. Yamaji; T. Ishii  Proc. Third Symposium Int’l. Soc. Rare Sugars, 293-296 (2006).  293  -296  2006
  • Protein engineering of PQQ glucose dehydrogenase and its application for glucose sensor.
    YOSHIDA, Hiromi; SODE, Koji  Recent Research Developments in Protein Engineering, Vol. 2, (Managing Editor; S.G.PANDALAI)(ISBN: 81-7736-147-3)  2-  185  -196  2002
  • Novel approaches toward bioelectrochemical applications of genetically engineered proteins - 2. Engineering of substrate specificity of PQQ glucose dehydrogenase
    H Yoshida; K Sode  ELECTROCHEMISTRY  68-  (5)  348  -352  2000/05
  • The alteration of substrate specificity of water-soluble PPQ glucose dehydrogenase by introducing mutations into the C-terminal loop region.
    Morimoto Akifumi; Igarashi Satoshi; Yoshida Hiromi; Sode Koji  日本生物工学会大会講演要旨集  12-  185  -185  2000
  • PQQグルコース脱水素酵素の基質親和性の改良
    吉田裕美; 早出広司  電気化学会  68-  (5)  348  -351  2000
  • Production of soluble recombinant PQQ glucose dehydrogenase in Klebsialla pneumoniae
    Kojima Katsuhiro; Yoshida Hiromi; Sode Koji  日本生物工学会大会講演要旨集  11-  144  -144  1999
  • The effect of site-directed mutagenesis into the membrane binding region of Escherichia coli PQQGDH on enzymatic activity.
    Suzuki Kuno; Okuda Junko; Yoshida Hiromi; Sode Koji  日本生物工学会大会講演要旨集  11-  147  -147  1999
  • Construction and characterization of multi-chimeric PQQ glucose dehydrogenase
    Sode Koji; Yoshida Hiromi  日本生物工学会大会講演要旨集  10-  278  -278  1998
  • Construction and Characterization of a Chimeric Escherichia coli PQQ Glucose Dehydrogenase (PQQGDH) with Increased EDTA Tolerance
    SODE Koji; YOSHIDA Hiromi  Electrochemistry  65-  (6)  444  -451  1997/06
  • PQQグルコース脱水素酵素におけるEDTA耐性支配領域の部位特異的変異による解析 : 微生物
    早出 広司; 吉田 裕美  日本農藝化學會誌  70-  263  -263  1996/03
  • キメラ蛋白質構築法による新機能蛋白質の開発
    早出 広司; 吉田 裕美  バイオインダストリー  13-  (3)  5  -12  1996
  • Determination of the metal binding region of pyrroloquinoline quinone glucose dehydrogenase
    K Sode; H Yoshida; N Yasutake  PROTEIN ENGINEERING  8-  (9)  51  -51  1995/09
  • Acinetobacter calcoaceticus由来PQQグルコースデヒドロゲナーゼのEDTA耐性を支配する領域の検討 : 微生物
    早出 広司; 吉田 裕美  日本農藝化學會誌  69-  228  -228  1995/07
  • Functional analysis of C-terminal region of PQQ glucose dehydrogenase
    Sode Koji; Ito Shunsuke; Matsumura Kazunori; Yoshida Hiromi  日本生物工学会大会講演要旨集  6-  99  -99  1994

Industrial Property Rights

Research Grants & Projects

  • Elucidation of molecular mechanism of novel iron-sulfur flavoprotein cytochrome dehydrogenase
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    Date (from‐to) : 2016/04 -2019/03 
    Author : Sode Koji
     
    This study focused on the elucidation of molecular mechanism of novel iron-sulfur flavoprotein dehydrogenase complex, which is composed of an FAD catalytic subunit, a small subunit and a 3-haem containing electron transfer subunit. The X-ray structure of Burkholderia cepacia derived FAD glucose dehydrogenase complex catalytic subunit complexed with the small subunit was determined. Together with biochemical and electrochemical analyses, following facts were elucidated. A 3Fe-4S iron-sulfur cluster exists at the surface of the catalytic subunit and serves the intra- and inter-molecular electron transfer from FAD to electron transfer subunit. In the electron transfer subunit, the haem 3 accepts electron from the iron-sulfur cluster, and then transfer to haem 2, which transfer electron to electrode, thereby realizes the direct electron transfer to electrode. Alternatively, heam 2 transfers electron to haem 1, which transfers electron to external soluble electron acceptor.
  • X-ray structure analysis of the enzyme for rare sugar production and elucidation of the mechanism of its thermal stability
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2016/04 -2019/03 
    Author : Yoshida Hiromi; IZUMORI ken; AKIMITSU kazuya
     
    The X-ray structure of ketose 3-epimerase from Arthrobacter globiformis M30, which was previously reported to be a D-allulose 3-epimerase (AgDAE), was determined. AgDAE formed a homotetramer and its overall structure was more similar to that of L-ribulose 3-epimerase (L-RE) than to the known structures of D-psicose (alternative name D-allulose) 3-epimerases (D-PEs or D-AEs), although AgDAE and L-RE have different substrate specificities. Both AgDAE and L-RE have long helices in the C-terminal region that would contribute to the stability of the homotetramer. AgDAE showed higher enzymatic activity for L-ribulose than D-allulose; however, AgDAE is stable and is a unique useful enzyme for the production of D-allulose from D-fructose.
  • Analysis of the species-specific molecular mechanism of C. perfringens-specific lytic enzyme Psm and its application
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2015/04 -2018/03 
    Author : Tamai Eiji; YOSHIDA Hiromi
     
    In this study, molecular mechanism of Clostridium perfringens specific lytic enzyme (Psm, Acp, CPE 1138) and its application study were carried out. The species specificity of Psm was found to be in its cell wall binding domain. In addition, enteric coarted preparations of Psm showed some effect on C. perfringens in the intestine. Furthermore, in this study, it was clarified that the catalytic domain of Acp adopts a crescent structure composed of three subdomains, and revealed that the reaction mechanism is Neighboring - group mechanism. In addition, the catalytic domain and cell wall binding domain of CPE 1138 were identified. Furthermore, crystals of the catalytic domain of CPE 1138 were obtained, and data with resolution of 2.0 angstroms was successfully obtained by X-ray structural analysis. Currently, this structural analysis is carried out.
  • Cell wall peptidoglycan recognition/hydrolysis mechanisms of Clostridium perfringens lytic enzymes based on X-ray structures
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2015/04 -2018/03 
    Author : Kamitori Shigehiro; TAMAI Eiji; NOGUCHI Keiichi
     
    Gram-positive bacteria possess a thick cell wall that surrounds their cytoplasmic membranes and provides physical protection. The bacterial cell wall is a mesh polymer of peptidoglycans, in which linear glycan backbones are cross-linked by species-specific peptide side chains. Autolysins can partially hydrolyze cell wall peptidoglycan into small sections to regulate cell separation/division and the growth-phase of bacteria. An X-ray structure of Clostridium perfringens autolysin catalytic domain was determined, giving new insights into the catalytic reaction mechanism for the hydrolysis of cell wall peptidoglycan. The pathogenesis and infectivity of Gram-positive bacteria are mediated by many surface proteins that are covalently attached to peptidoglycans of the cell wall. The covalent attachment of these proteins is catalyzed by sortases. X-ray structures of Clostridium perfringens sortase B and its inactive mutant form were determined.
  • The study on inclusive catalytic reaction mechanism of the enzymes used for rare sugar production on the basis of X-ray structures in complexes with rare sugars
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2013/04 -2016/03 
    Author : Yoshida Hiromi; KAMITORI SHIGEHIRO; YOSHIHARA AKIHIDE; IZUMORI KEN
     
    X-ray structures of L-ribose isomerase from Acinetobacter sp. and Cellulomonas parahominis were determined. On the basis of the wild-type and mutant form structures in complexes with rare sugars, catalytic reaction mechanism of L-RI including ring-opening mechanism of sugar was proposed. Furthermore, mutant structure analysis supported the essentiality of tetramer formation of L-RI for its enzymatic activity.
  • Functional and pathogenic analysis of carbohydrate-active enzymes from Clostridium perfirngens
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2012/04 -2015/03 
    Author : MIYATA Shigeru; MORIYAMA Ryuichi; OKABE Akinobu; NARIYA Hirofumi; YOSHIDA Hiromi; NAKAKITA Shinichi
     
    Clostridium perfringens is notable for their genomic content of numerous open-reading frames that encode carbohydrate-active enzymes. Among them, hyaluronidase is thought to function as virulence factors. This enzyme is believed to spread the organism in infected tissues or potentiate other toxins through facilitation of their diffusion via the degradation of hyaluronan, NagH has been partially purified as hyaluronidase from the organism (Canard, et al., 1994). In this study, we successfully purified NagH and the products of nagH paralogs, NagI, NagJ, NagK and NagL with high quality from recombinant C. perfringens cultures. These recombinant enzymes exhibit exo-N-acetyl-β-glucosaminidase activity but not hyaluronan degrading activity. These results led us question whether C. perfringens Nag(s) could genuinely hydrolyze hyaluronan. Thus, we searched and found a genuine gene of hyaluronidase in the organism, and indicated that the product exhibits hyaluronan degrading activity.
  • Carbohydrate recognition mechanisms of galectins and carbohydrate processing enzymes deduced from X-ray structures
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    Date (from‐to) : 2011/04 -2014/03 
    Author : KAMITORI Shigehiro; YOSHIDA Hiromi; NISHI Nozumu; NAKAKITA Shinichi; MIYATA Shigeru; HOJO Hironobu
     
    Cell surface oligosaccharides are involved in immune responses and bacterial/viral infections, and they are specifically recognized by carbohydrate-binding proteins. X-ray structures of the complexes of carbohydrate-binding proteins with the target oligosaccharides have been determined to elucidate the carbohydrate recognition mechanisms. The results of this research project give new insights into the carbohydrate recognition mechanisms of galectin-8, a hemagglutinin subcomponent of the botulinum neurotoxin, and an endolysin encoded by episomal phage of Clostridium perfringens.
  • X-ray structure analysis of rare sugar producible enzymes aiming for elucidation of novel isomerization mechanism
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    Date (from‐to) : 2011/04 -2013/03 
    Author : YOSHIDA Hiromi
     
    X-ray structure of a novel isomerase, L-ribose isomerase from Acinetobacter sp. (L-RI) was determined. L-RI can catalyze reversible isomerization between L-ribose and L-ribulose, and is a plausible enzyme for rare sugar production. In the structure analysis, L-RI showed the dimer formation. The monomer structure of L-RI is similar to that of D-lyxose isomerase from Escherichia coli O157:H7. L-RI retains a metal ion in the active site with three histidines. Two glutamates are putative catalytic residues.
  • Signaling-molecular mechanism of a novel microglia EF-hand protein Iba1 deduced from X-ray structures
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2008 -2010 
    Author : KAMITORI Shigehiro; YOSHIDA Hiromi
     
    Iba1 with 147 amino acid residues has been identified as a novel calcium-binding EF-hand protein, expressed in microglia/macrophages, and is expected to be a key factor in the activating of microglia. To elucidate signaling-molecular mechanism of Iba1, X-ray structural analysis and dynamic light scattering experiment of Iba1 were done. The results showed that Iba1 exists as a dimer in solution, and that Iba1 changes its oligomer state from dimer to monomer, depending on the hydrophobic environment.
  • Crystal structure analysis of rare sugar producible enzymes for their effective production by protein engineering
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    Date (from‐to) : 2007/04 -2009/03 
    Author : YOSHIDA Hiromi
     
    天然には微量にしか存在しない「希少糖」は糖としての食品分野への応用だけではなく医療分野においても希少糖の利用価値が期待されている。本研究は「希少糖」の生産に利用される酵素のより効率的な生産を目指した分子設計に有用な情報を得ることを目的に、希少糖生産酵素の構造・機能解析を行った。本研究において、Pseudomonas stutzeri由来L-ラムノースイソメラーゼについては変異酵素を触媒機構に関する詳細な情報が得られ、Pseudomonas cichorii由来D-タガトース3-エピメラーゼとBacillus pallidus由来D-アラビノースイソメラーゼの構造を新たに決定した。
  • Structural study of the microglia/macrophage-specific protein Iba1 from human and mouse having an actin-binding activity
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2006 -2007 
    Author : KAMITORI Shigehiro; YOSHIDA Hiromi
     
    Iba1 (ionized calcium-binding adaptor molecule 1) with 147 amino acid residues has been identified as a calcium (Ca^<2+>)-binding protein, expressed specifically in microglia/macrophages, and is expected to be a key factor in membrane ruffling which is a typical feature of activated microglia. We have determined the crystal structure of human Iba1 in Ca^<2+> free form and mouse Iba1 in Ca^<2+> -bound form, to a resolution of 1.9 A and 2.1 A, respectively. X-ray structures of Iba1 revealed a compact, single-domain protein with two EF-hand motifs, showing similarity in overall topology to partial structures of the classical EF-hand proteins troponin C and calmodulin. In mouse Iba1, the second EF-hand contains a bound Ca^<2+>, but the first EF-hand does not, which is often the case in S100 proteins, suggesting that Iba1 has S100 protein-like EF-hands. However, the molecular conformational change induced by Ca^<2+>-binding of Iba1 is different from that found in the classical EF-hand proteins and/or S100 proteins, leading to the formation of a dimer in a crystal, which demonstrates that Iba1 has an unique molecular switching mechanism dependent on Ca^<2+>-binding. The dimer has the shape of a slightly flat quadratic prism with the characteristic charge distribution; negatively charged regions are widely distributed on the upper surface and sides, while the unusual positively charged region is found at the center of the lower surface. It is likely that this positively charged region interacts with a target molecule. To elucidate the oligomeric state of Iba1 in a solution, cross-linking experiments was done, showing that Iba1 partially forms a dimer in a solution. To investigate whether a dimer Iba1 can interacts with target molecules or not, we also done surface plasmon resonance studies, but a clear evidence for this has not yet been obtained.
  • Structural Study of Thermoactinomyces vulgaris R-47 Cyclodextrin Transport and Metabolic Pathway
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    Date (from‐to) : 2004 -2005 
    Author : KAMITORI Shigehiro; SAKANO Yoshiyuki; YOSHIDA Hiromi
     
    Thermoactinomyces vulgaris R-47 produces two α-amylases, TVA1 and TVA2. TVA1 as an extracellular enzyme favors high molecular weight substrates like starch and pullulan, while TVAII as an intracellular enzyme favors low molecular weight substrates and can efficiently hydrolyze cyclodextrins, by what is called cyclodextrinase activity. The gene mapping showed that the genes of ABC transporter (CDK), cyclodextrin binding protein (CDE), transport membrane proteins (CDF, CDG), TVA2, glucoamylase (TGA), and a repressor protein (CDI) are sequentially located. Therefore, it is expected that T.vulgarius has the gene cluster encoding proteins related to the novel cyclodextrin ransport and metabolic pathway. The final goal of this proposal research project is to understand the T.vulgarius cyclodextrin ransport and metabolic pathway based on the structure information derived from protein X-ray crystallographic methods. (1)The X-ray structures of TVA1/oligosaccharides complexes were successfully determined, showing the unique substrate recognition mechanism of TVA1 (FEBS J. 272, 6145-6153, (2005)). (2)The X-ray structures of TVA2/cyclodexrins and oligosaccharides complexes were successfully determined, showing the multiple substrate recognition mechanism of TVA2 (J.Biol.Chem. 279, 31033-31040, (2004), J.Appl.Glycosci., 52, 225-231, (2005), Carbohydr.Res., 341, 1041-1046, (2006)). (3)Crystallization and preliminary X-ray analysis of TGA were reported (Acta Crystallogr., F61, 302-304, (2005)). (4)The X-ray structure of CDE/γ-CD complex at 2.4Å resolution was successfully determined. The coordinates have been deposited to Protein Data Bank (2DFZ). (5)The overexpression of CDF, CDG and CDK were successfully done as soluble trigger-factor fused proteins, using pColdTF (Takara). (6)Crystallization and preliminary X-ray analysis of CDI were successfully done.
  • Development of double stranded DNA sensing fluorescent proteins and the application for highly sensitive Salmonella detection
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2001 -2002 
    Author : NARITA Mitsuaki; YOSHIDA Hiromi; NARITA Mitsuaki
     
    In recent years, salmonellosis is widespread throughout the world. For the rapid and sensitive detection of Salmonella have been paid Increasing demand. We have started research to develop a novel method for the detection of a double -stranded DNA with a specific sequence using an fluorescent-labeled engineered DNA-binding protein, DnaA.. DnaA is known to bind to bacterial oriC region. The DNA fragment detection system is based on fluorescence resonance energy transfer (FRET) between fluorescent -〓beled oriC and DnaA . First, we constructed fusion proteins between green fluorescent protein (GFP) and DnaA (GFP-DnaA). GFP-DnaAs showed fluorescence in recombinant E. coli in vivo. However, fusion proteins were produced as an inclusion body and the refolding of the target fusion protein was not achieved. Second, we constructed DnaAIV, a fusion protein of the DNA-binding domain of DnaA and glutathione S- transferase. DnaAIV was produced mainly in inclusion body fraction in recombinant E. coli however the refold of this fusion protein was successfully achieved. Fluorescein -5- maleimide (F5M) -labeled DnaAIV bound to Salmonella's oriC region which was labeled by 6-carboxytetramethylrhodamine (TAMRA) or hexachloro -6- carboxy - fluoresceine (HEX). F5M derived fluorescent intensity was reduced when TAMRA or HEX labeled oriC was added. No fluorescent change was observed when control DNA was added. These results show FRET, based on DnaA-oriC specific binding is a useful technique to detect Salmonella.
  • Development of a novel enzymatic synthesis method for trehalose derivatives and its application
    Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research
    Date (from‐to) : 2000 -2001 
    Author : SODE Koji; YOSHIDA Hiromi
     
    We aimed at the development of novel enzymatic synthesis method of the trehalose derivatives and those applications to insecticides or anti-fungal chemicals. Trehalose is a disaccharide and commonly found in fungi, algae and in several invertebrate phyla but not in flowering plants and vertebrates. It presents in all insects and in many insects it is present in high concetration s and constitutes the major hemolymph sugar. Trehalose secifically hydrolyzed trehalose and is the rate-limiting enzyme in the process of glycogen synthesis from hemolymph trehalose in developing ovaries of the silkworm. Therefore the specific inhibitor for trehalases is a candidate of novel insecticides. We purified glucose-3-dehydrogenase from Halomonas sp. A -15 and found its activity to produce trehalose derivatives. One of those derivatives, 3,3'-diketotrehalose showed an inhibitory activity to trehalose, and therefore we investigated its activity as insecticide or anti-fungal chemicals. It did not show anti-fungal activity but it can be an insecticide. We also investigated its efficient production process, and found the enzymatic production is more efficient than microbial production. By using potassium ferricyanide as electron acceptor and the highly purified glucose-3-dehydrogenase, 80% productivity was attained. Hence we established efficient method to produce 3,3'-diketotrehalose, it can contribute as a novel effective insecticide which is not harmful to animals.

Committee Membership

  • 2017/03 -2021/02   Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry   member of editorial board of KAGAKU TO SEIBUTSU

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